Nacio de un proyecto de unos alumnos de la universidad de Berkley en 1995, se llaman Spencer Kimball y Peter Mattis. Durante casi años lo desarrollaron ellos solos y después en Enero de 1996 publicaron la versión 0.54 que incluia el sistema de ampliación por Plug-ins, que fue uno de sus grandes ventajas, permitiendo el ampliar las posibilidades de GIMP de una forma rápida. Desde entonces no se ha parado de crecer y grandes poyectos surgieron alrededor de esta aplicación, como GNOME, que decidio usar el sistema de creación de Widgets que GIMP usaba y fue creado por GIMP, GTK.